当天文学家在十七世纪首次将望远镜转向木星时，他们便注意到在这个巨大的行星上有一个显着的红斑，这个大红斑至今已经存在於木星大气中叁百年多了，现在天文学家知道其实它是一个大气旋，就像地球上的台风，不同的是，它是以顺时钟方向旋转，显示这是一个高气压系统。大红斑的直径达 25000 公里，占木星本身直径的六分之一，为地球的两倍大，风速每小时达 430 公里，是目前太阳系中已知规模最大的暴风。这个暴风之所以寿命如此之长归因於木星为一个气态行星，没有固态的表面，没有地面摩擦力会破坏暴风结构或消耗其能量，但是从哈伯望远镜在 1992~1999 年所拍摄的一系列照片中可以看出，木星大红斑的形状、大小与颜色都会有所变化。天文学家常常藉着观测其他行星的天气现象来增加对地球气候的了解。由於木星缺乏固态表面，所以等於提供了一个地球上所没有的天然气象实验室，而这些知识可以应用於地球深海上空的大气情形。