齐秦是王祖贤惟一公开承认过的恋人。1987年5月，两人因合作拍摄《芳草碧连天》而传出恋情。

　　1990年5月，当齐秦在香港事业正如日中天时，传出他与王祖贤分手的消息，据说与王祖贤移情别恋有关。齐秦泪洒香江，黯然回到台湾，声言不再踏上香港这块伤心地。

　　齐秦回台后，两人的恋情死灰复燃。但此时两人已不再公开示众，只维持一种地下情。两人的感情就这样维持了6年，情到深处，还一起去畅游美国。

　　1993年9月，豪门公子林建岳3000万豪宅赠佳人，赢得王祖贤芳心。同年，林建岳正式与太太谢玲玲分居。齐秦听到王祖贤与林建岳的绯闻伤心之极。不相信心高气傲的王祖贤竟会投入林建岳的怀抱。他从台北打电话给王祖贤，只问一句：“报上写的是不是真的？”王祖贤如何回答，只有齐秦知道。他没有再说一句话，便黯然挂上电话。

　　齐秦仍保持对王祖贤的一片痴心，他相信会有那么一天，王祖贤终会回到自己的身边。所以，虽然王林恋热火朝天，他却只是沉默地去写他的歌。他先后写出《无情的雨，无情的你》、《痛并快乐着》等歌曲，在歌声里寄托对王祖贤深深的爱恋。

　　王祖贤与林建岳不再遮遮掩掩，不少人都以为两人这回是来真的了。但知子莫若母，林建岳的母亲不以为然：“你看他会玩她超过两年？”果然，1996年底，传言因为杨采妮的介入，林、王分手。分手后的王祖贤，远遁加拿大，每日以泪洗面。这时，旧情难了的齐秦推出了新专辑《不让你的眼泪陪我过夜》，再一次深深地表达了他对王祖贤的思念。远在加拿大的王祖贤听到这首歌，感动得热泪盈眶。终于有一天，她突然拿起了电话，只说了一声：“喂，齐吗？”齐秦一愣之下赶紧说：“宝宝！……你什么时候回来，我去接你。”

　　1997年1月中旬，齐秦和王祖贤突然双双出现在东京羽田机场，立即引起一场不小的骚动。至此，齐秦、王祖贤算是回复了往日的情缘。

　　齐秦和王祖贤的关系逐步稳定，唱片公司决定为他们举行一个新闻发布会。1998年3月19日，齐秦、王祖贤记者招待会在台北凯悦饭店举行，数百位记者涌入，镁光灯淹没了一切。

　　3年沉寂，王祖贤再度面对媒体，她说：“我的做事态度是不管对错我都尝试，都去接受。错了，我承认。有3年没有公开露面，这段时间感谢男朋友齐秦能够……”一句话没说完，她已哭成泪人儿。她表示和齐秦之间是缘分，她最想对齐秦说的话是“非常感谢你”。说着说着便泪水决堤。在感情上，曾像贪玩小孩的王祖贤，如今已真的懂得珍惜。

　　齐秦大方地谈到复合。他说，一个人若是真的喜欢另一个人，不愉快就会付诸流水，尤其身处演艺圈，要比一般人更要爱得坚强。他说，在情变时也曾检讨自己的责任，以前爱喝酒，又呆板，显得冷漠、乖张，无法给女友安定感。

　　在传媒面前，齐秦公开向王祖贤求婚，希望两人在2000年结婚。后来因为2000年齐秦的“认子风波”，婚期耽搁下来。

　　两人兜兜转转十多年，感情经历无数的风雨，如今总算迎来了彩虹。