1938年初，国都沦陷，华东尽在日寇控制之中。日军报道部开始在租界内检查中国人所办之华文报纸，禁止宣传抗日。共产党《救亡日报》迁往广州出版，立报、时事新报、大公报、申报或停刊，或迁走。

时势造诗人。京杭、沪杭铁路局高级职员，严宝礼等，在聚会中约定，以铁路局发放的遣散费创办报纸：文汇报。为避免日方骚扰，高薪雇佣英国人克明，以英商名义出版发行。

1月25日，文汇报（Standard News）出版，日出对开四版一大张。馆址在福州路436号。编辑和印刷在爱多亚路大同坊。同当时代的报纸的精神气质一脉相承，文汇报发表了《为本报创刊告读者》，“本报本着言论自由的最高原则，绝不受任何方面有形与无形的控制”，“消息力求其正确翔实，言论更须求其大公无私，揭穿黑幕，消除谣言。”

当天第一版头条：本报郑州电 津浦线发生激烈战斗，我国军队两路包围济宁日军。第四版为副刊《文会》。
　　　
情况并非这么顺利。


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2月1日，文汇报发表社论《上海并非孤岛》，说：“地球上没有一个真正的孤岛，上海尤其不能和内地脱离关系。”居住在上海的人“应该时时刻刻紧紧把握住你们的灵魂，应该时时刻刻记住你处的地位。”
2月7日，文汇报又发表社论《告若干上海人》，对投敌的工商界几个人提出警告，叫他们不要“去当小丑”。“切勿恋着昙花一现的幻景，被漫天的风沙，葬送了自己！”
2月9日，文汇报报馆接到“正义团”的名义发来的信，警告文汇报的反日情绪。
2月10日 文汇报发表社论《读蒋委员长演词后》，称其思虑战苦，甘受指摘，委曲求全，至77事变，遂毫不游移，决心抗战，几个月来，虽备尝痛苦，但决不轻于言和。
当天下午六点左右，一人闯入福州路报馆，投掷木柄手榴弹一枚。一人重伤，两人轻伤。重伤者后不治。

文汇报创刊不多日，胡政之以他人名义向文汇报注资1万元，并在2月20日左右派徐铸成担任文汇报主笔，成为报馆编辑部实际负责人。胡惠生仍保留总编辑名义。柯灵亦于10日左右参加文汇报，负责副刊编辑。

3月1日，一水果店学徒送来一箱蜜橘并一只已腐烂之人手臂，附信称：文汇社长，此乃抗日者之手腕，送与阁下。希望阁下更改笔调……

3月21日，文汇报一版刊登涨价启事，理由是销数激增、增加篇幅而纸价昂贵。一月定价8角半年4元二角全年8元。次日头版头条报道临沂大捷。当晚11时3刻，有三人乘小汽车至报馆口，开枪击伤守门中国巡捕，并向报馆大门内投掷木柄手榴弹2枚，炸伤一名过路行人。3月27日下午，爵禄饭店服务员将三花篮水果送至报馆，附有一封英文信，大意是敬佩文汇报抗日爱国思想言论报道，送水果以表敬意。经查，水果中注射有毒液。

4月1日，头版头条报道台儿庄大捷。8日头条：沪江大学校长刘湛恩被暗杀。

5月16日，《世纪风》副刊发表武汉文化界声讨周作人的报道。23日，整版介绍《鲁迅全集》。5月27日发表社论《北方之曙光》，说“河北省中部，全为游击队所控制，其中心区域，近已扩充至二十余县，流动游击战事，几遍及全省。”“我们对于中国抗战的前途，始终是乐观的，因为从根本上看，中国民众既已全部觉醒，决非任何暴力所能征服。”

5月28日，文汇报赠送“文汇杯”，支持震旦大学举办慈善足球赛。6月9日，发表译文《苏联第三次五年计划全貌》，副刊发表阿英笔名撰写的《关于瞿秋白的文学遗著》。

6月11日，社论《信任领袖》发表，称蒋介石多年忍辱负重，他对中日双方力量估计最清楚，他从来没有说过过分乐观的话，现在在接受外国记者采访时忽然如此乐观，足见黎明来之不久了。6月21日，社论《一个建议》遭到读者严重不满，纷纷来信质询文汇报态度，是否坚持抗日。《建议》称日本已疲惫，世界和平大会应迅速召集，以和平国家得力量收拾残局，重造远东均势。盖18日外电称宇垣对记者谈话，如大局有根本变动，日本将重新考虑其态度，暗示日中议和之可能。

文汇报销量一度大幅度下滑。

7月1日，文汇报改出3大张半，售价不变。版面有要闻、社论、通讯、国际新闻、郊县新闻、本市新闻、经济新闻、教育体育新闻、副刊灯塔、各地乡讯、社会服务、世纪风等。7月17日，改出四大张。

10月22日，刊登新闻《汪兆铭不识时务，又发表谈话侈言和平》，并配发短论。10月26日，一版头条，我国军队全部撤离武汉。11月22日，社论《长沙大火善后》。12月31日，第一版发表《汪果已堕落乎？》为题的新闻，短评《汪精卫切腹》称，如果所传属实，汪精卫简直自绝于人类。

1939年元旦，文汇报增出新年增刊三大张、《文汇报元旦图画增刊》，并随报附送该年度日历一张。之后的一段时间内，文汇报对汪精卫判国进行了新闻报道及言论抨击。1月2日，副刊《世纪风》发表了《孤岛文学的轻骑——一年来上海创作活动的回顾》。
1月15日，文汇报发表社论《中国决不赤化》，说汪精卫手下若干小政客大放谣言，认为中国要赤化。社论说：“赤化并不是一个坏名词，共产主义决非洪水猛兽，苏联式的政治经济社会组织，也的确合乎人类进化的理想，但中国决不会走这条路，因为它不适合中国的环境，于目前的需要更相去甚远。”各党各派，“先后放弃成见，信奉三民主义，集中力量，凝成目前的民族抗战阵线。”
5月18日，出完当天的文汇报后，接英国驻上海领事馆通知，文汇报及文汇报晚刊停刊两星期。5月19日，申报（以外商名义出版得以复刊）刊登《英商文汇有限公司启事》，告之停刊。
6月1日，文汇报及文汇报晚刊被要求停刊两周期满的日子，但是报纸仍未复刊。但在申报上出现一则声明《文汇报编辑部全体同人紧急启事》：同人等服务《文汇报》一年有半 立场坚定 向为社会人士所深悉 兹因报馆内部发生变动 严经理去职 特向本报当局提出要求 保证不变本报原来编辑方针 庶得保持本报一贯立场 在未获得满意答复以前 同人等暂不参与编辑工作 一俟交涉获有结果 自当另行声明”。
但是，6月10日的申报上又刊登《英商<文汇报>展期复刊启事》，称因内部整理未就绪，将尽快出版。6月14日，申报又刊登英商文汇有限公司通告，称严宝礼辞职后，克明将继任。
从这以后，文汇报停刊史料从报章间消失。

据文汇报编辑部负责人徐铸成等回忆，克明当时已被汪系汉奸收买，组织了一个汉奸编辑班子，准备以文汇报名义继续出版。编辑部人员被迫采取“玉碎”手段。根据英国公司法，企业有三分之一股权反对，则不得再经营。严宝礼等乘文汇报停刊股价下跌，购进一批股票凑足三分之一股权，申请停止经营文汇报。申请书经托熟人转给英国驻华大使，称克明所为危及中英邦交。英国驻华使馆遂要求上海领馆吊销文汇报经营执照。文汇报历史上第一次停刊。

一九四五年

日本投降。文汇报于8月18日在新闸路小沙渡路一家印刷厂内复刊。此段时间至9月5日都以号外形式出版，不计入正式刊号。9月6日，报纸改版，报社迁至圆明圆路。报纸由中央日报社承印。当天文汇报出对开一大张，另出《欢迎国军图画特辑》画报一张。这段时间的文汇报，充分报道了国民政府的接收进程。

10月4日，副刊《世纪风》发表重庆剧作家联谊会来信，要求代为声明：本会会员作品一律保留转载、演出、翻译、广播、摄制电影及其他一切著作权益。并发表全体会员名单：欧阳予倩、丁西林、熊佛西、田汉、陈白尘、老舍等。


10月27日，文汇报一版发表短评《战时痛苦的延长》，忧虑内战。文中说：“这几天来，从各方面传来的消息，恐怕战时痛苦还要延长下去”，这真是“人间最悲惨的厄运”。

10月30日，文汇报头版又发表报道《共军行动逐渐扩大 政府处以最大忍耐》。短评《向中共呼吁》，说“全国人民也只有一种主张，认为消弭内战的方法，只有绝对拥护中央。”“如果中共当局，执迷不悟，仍欲一意孤行，不惜引起内战，使我民族陷于万劫不复之绝境，则其为民族罪人，是不可饶恕的”。

11月1日，社论《请问毛泽东先生》说，“我们只想先请教毛泽东先生一个问题，就是中共的根本政策，是不是真正主张中国的团结进步？”

11月9日，副刊《世纪风》发表聂绀弩的新诗《命令你们停战》。

11月20日，社论《阴霾四合的东北》，认为近来“东北的局势的严重，已到了顶点”。“吾人虽欲讳言内战，但残酷的事实，放在我们的眼前，怎能熟视无睹。”“本市参政员奚玉书和陶百川二氏，为听取上海父老对于时局的见解，昨日举行招待会，席间曾有白须垂胸的革命前辈袁希洛先生，慷慨陈词，大声疾呼的要求政府派飞机来沪，送他到延安去，在毛泽东面前绝食而死。”

11月25日，社论《何故压制学潮》。对近日昆明学生反对内战发生学潮引发流血，认为“每一个青年都能置身于政治涡流之外，宁宁静静地研究学习，为国储用，但这个责任，显然在政府而不在青年本身。”