某年某月某日,在柯南和哀等人的努力之下,终于将黑暗组织一举摧毁.哀也顺利制得解药,和柯南一起变回了原样.
正当志保打算离新一而去之时,正在调查黑暗组织的目暮给新一和志保送来了惊人的消息:
据调查,宫野志保所使用的身份全部是伪造的.包括她所谓的父母和姐姐,也全是组织为欺骗志保而编造的.而志保真正的名字,她真正的名字是----
工藤志保.
原来,在新一之前,优作和有希子还有过一个女儿,----工藤志保.
于是,志保终于明白自己为何会对新一无比的信任与依赖,原来对新一那种朦胧的好感是来自于对亲弟弟的牵挂之情.
但更多的谜题出现了:为什么新一的父母要隐瞒真相?志保为什么会落在黑暗组织手中? 优作和有希子置儿子的安全于不顾双双跑到国外的原因究竟是什么?…名侦探工藤新一即将展开新一轮的推理.

总之,无处可去的志保就搬进了博士的隔壁,与新一同住.(反正是姐弟嘛)
从此,新一虽再也不必一口一个兰姐姐地听命于小兰,却又有了个整日管教自己的”志保姐”……