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南京大学与东南大学同位于六朝古都的文化名城南京。两校地理位置非常相近，学科互补性强；南京大学是以文理为主的综合性大学，东南大学是以工科为主的综合性大学。两校同气连枝，均由原中央大学演化而来。52年的院系调整，强行将原南京大学肢解成现南京大学与东南大学（即原南京工学院），以及若干所其他的专科性学校。与祖国大陆和台湾一样，两校已经历了长达近半个世纪的“骨肉分离”状态。改革开放以来，两校的统一一直是两校领导、全体师生员工所关心和议论的话题，也是很多有识之士的一贯心愿。但是，毕竟分离得太久，加之类似于台独的势力的存在，两校在很多认识上存在着严重的差异，致使至今仍未统一。由此直接导致了江苏省高教发展的停滞不前。
最近一段时间以来，两校党政领导通过“三讲”教育，思想认识上有了很大的提高。特别自学习了江总书记的“三个代表”以来，两校领导的思想认识上产生了质的飞跃。领导们一致认为高校是先进生产力的源泉，而文理工剥离将严重阻碍先进生产力的形成。两校所在的南京蕴含着极其丰富的六朝中华文化、特别是大明汉文化。高校乃先进文化的发源地和传播者。两校的统一无疑将极大促进中华文化的弘扬与发展。最后，领导们认为，两校统一将极大地促进江苏、乃至全国高教的政治、经济、文化、科技的发展，代表了全江苏人民和全国人民的根本利益。与此同时，两校党政领导深入揭批了李登辉、陈水匾、吕秀莲之流的台独思想，认识到类似的思想也存在于两校的统一进程中。两校领导纷纷表示，坚决反对分裂主义、个人英雄主义、本位主义，为弘扬中大精神、中华文化而奋斗！
同时，两校领导清醒地认识到，国内高教界硝烟四起，合并、兼并浪潮起伏不断。南京高校在这方面大大滞后，非常不利于江苏高教的发展。领导们坚决表示，实行强强联合，促进学科发展；北抗北清，南抵复浙，在高校竞争中处于优势地位。江苏省副省长王珉同志特别指出，“由于思想保守，观念落后，江苏在经济、教育等多方面已严重地落后于兄弟省份浙江。现在应该是江苏向浙江学习的时候了。我希望，南大与东大的统一是我们江苏省再次全面赶超浙江的一个重要契机。”
考虑到历史与现实，两校党政领导商定，统一进程将分阶段进行：
一、成立校统委，部署统一的战略方针；
二、实行“一校两制”，两校保持现有体制，五年不变；
三、实现完全统一，重新调整和部署下属院系；
四、在适当的时候，收回分到全国其他院校中的原中大系科；
五、在适当的时候，以“一校两制”方式实现与台湾中央大学的统一（五十年不变）。
附件：
一、 两校和平统一委员会（校统委）
主任： 李岚清
常务副主任： 陈至立
副主任： 蒋树声 顾冠群
顾问：曲钦岳、钱仲韩
（为了避免不必要的干扰，教育部与两校有关的领导不参加校统委）
二、 新校名：
考虑到历史与现实，两校领导认为，启用“中央大学”的校名不符合“三讲”精神，“东南大学”的校名尽管存在一定的历史合理性，但该校名历史上存在时间极短，在民众中的知名度不高，并且，容易使人产生误解。相反，“南京大学”校名在国内外由较高的知名度，已经成为中国高校的品牌。故决定新校名为“南京大学”。
三、 新南京大学领导机构组成办法：
由教育部直接委派新南京大学的临时校长、副校长各一名；“一校两制”体制结束后，校长、副校长（各一名）由新南京大学全体员工选举产生；党委书记从其它院校或中央直接调入，以避免产生新的宗派体系（不设副书记）。在“一校两制”期间，两校的现党政机构行使分校党政的职能，受教育部委派的校长、书记直接领导。所组建的各学院院长行使副校长职能，学院党委书记行使校副书记的职能。
四、 院系设置：
在实行“一校两制”期间，基本保持现南大、东大的院系体制，同时将一校相对较弱的学科并入另一校较强的学科；例如，东大的文理学科并入南大的相应学科，南大的医学院并入东大的医学院；东大的计算机并入南大的计算机，南大的电子并入东大的电子，以此类推。“一校两制”结束后，撤销两校的分校级领导体制，各院系受统一的南京大学校级党政直接领导。
文学院：南大中文、历史系 + 东大中文、艺术系；
法学院：南大 法学院 + 中大 法律系；
商学院：南大商院 + 东大经贸系、金融系；
理学院：南大天文、数学、物理 + 东大物理、数学系；
地学院：南大地球科学、大地海洋、大气科学系
医学院：东大医学院、基础医学、临床医学、卫生 + 南大医学院
外国语学院：南大外语学院、外语部 + 东大外语系；
计算计学院：南大计算机系 + 东大计算机系；
电子信息学院：东大无线电、电子工程 + 南大电子系；
生命科学学院：南大生命科学院、分子生物研究所 + 东大生物医学工程系；
环境资源学院：南大环境科学与工程学院 + 东大环境工程系
化学化工学院：南大化学化工学院 + 东大化工系
交通运输学院：东大交通学院
材料科学与工程学院：南大材料系、化院部分材料有关的学科 + 东大材料系；
土木与建筑工程学院：东大建筑、土木工程 + 南大城市资源与规划、地质工程等；
电气与机械工程学院：东大电气、动力、自控、机械、仪器、力学
社会科学与工程学院：南大哲学、宗教、政治、社会 + 东大社科、哲科、管理、工商；
最近一段时间以来，两校党政领导通过“三讲”教育，思想认识上有了很大的提高。特别自学习了江总书记的“三个代表”以来，两校领导的思想认识上产生了质的飞跃。领导们一致认为高校是先进生产力的源泉，而文理工剥离将严重阻碍先进生产力的形成。两校所在的南京蕴含着极其丰富的六朝中华文化、特别是大明汉文化。高校乃先进文化的发源地和传播者。两校的统一无疑将极大促进中华文化的弘扬与发展。最后，领导们认为，两校统一将极大地促进江苏、乃至全国高教的政治、经济、文化、科技的发展，代表了全江苏人民和全国人民的根本利益。与此同时，两校党政领导深入揭批了李登辉、陈水匾、吕秀莲之流的台独思想，认识到类似的思想也存在于两校的统一进程中。两校领导纷纷表示，坚决反对分裂主义、个人英雄主义、本位主义，为弘扬中大精神、中华文化而奋斗！
同时，两校领导清醒地认识到，国内高教界硝烟四起，合并、兼并浪潮起伏不断。南京高校在这方面大大滞后，非常不利于江苏高教的发展。领导们坚决表示，实行强强联合，促进学科发展；北抗北清，南抵复浙，在高校竞争中处于优势地位。江苏省副省长王珉同志特别指出，“由于思想保守，观念落后，江苏在经济、教育等多方面已严重地落后于兄弟省份浙江。现在应该是江苏向浙江学习的时候了。我希望，南大与东大的统一是我们江苏省再次全面赶超浙江的一个重要契机。”
考虑到历史与现实，两校党政领导商定，统一进程将分阶段进行：
一、成立校统委，部署统一的战略方针；
二、实行“一校两制”，两校保持现有体制，五年不变；
三、实现完全统一，重新调整和部署下属院系；
四、在适当的时候，收回分到全国其他院校中的原中大系科；
五、在适当的时候，以“一校两制”方式实现与台湾中央大学的统一（五十年不变）。
附件：
一、 两校和平统一委员会（校统委）
主任： 李岚清
常务副主任： 陈至立
副主任： 蒋树声 顾冠群
顾问：曲钦岳、钱仲韩
（为了避免不必要的干扰，教育部与两校有关的领导不参加校统委）
二、 新校名：
考虑到历史与现实，两校领导认为，启用“中央大学”的校名不符合“三讲”精神，“东南大学”的校名尽管存在一定的历史合理性，但该校名历史上存在时间极短，在民众中的知名度不高，并且，容易使人产生误解。相反，“南京大学”校名在国内外由较高的知名度，已经成为中国高校的品牌。故决定新校名为“南京大学”。
三、 新南京大学领导机构组成办法：
由教育部直接委派新南京大学的临时校长、副校长各一名；“一校两制”体制结束后，校长、副校长（各一名）由新南京大学全体员工选举产生；党委书记从其它院校或中央直接调入，以避免产生新的宗派体系（不设副书记）。在“一校两制”期间，两校的现党政机构行使分校党政的职能，受教育部委派的校长、书记直接领导。所组建的各学院院长行使副校长职能，学院党委书记行使校副书记的职能。
四、 院系设置：
在实行“一校两制”期间，基本保持现南大、东大的院系体制，同时将一校相对较弱的学科并入另一校较强的学科；例如，东大的文理学科并入南大的相应学科，南大的医学院并入东大的医学院；东大的计算机并入南大的计算机，南大的电子并入东大的电子，以此类推。“一校两制”结束后，撤销两校的分校级领导体制，各院系受统一的南京大学校级党政直接领导。
文学院：南大中文、历史系 + 东大中文、艺术系；
法学院：南大 法学院 + 中大 法律系；
商学院：南大商院 + 东大经贸系、金融系；
理学院：南大天文、数学、物理 + 东大物理、数学系；
地学院：南大地球科学、大地海洋、大气科学系
医学院：东大医学院、基础医学、临床医学、卫生 + 南大医学院
外国语学院：南大外语学院、外语部 + 东大外语系；
计算计学院：南大计算机系 + 东大计算机系；
电子信息学院：东大无线电、电子工程 + 南大电子系；
生命科学学院：南大生命科学院、分子生物研究所 + 东大生物医学工程系；
环境资源学院：南大环境科学与工程学院 + 东大环境工程系
化学化工学院：南大化学化工学院 + 东大化工系
交通运输学院：东大交通学院
材料科学与工程学院：南大材料系、化院部分材料有关的学科 + 东大材料系；
土木与建筑工程学院：东大建筑、土木工程 + 南大城市资源与规划、地质工程等；
电气与机械工程学院：东大电气、动力、自控、机械、仪器、力学
社会科学与工程学院：南大哲学、宗教、政治、社会 + 东大社科、哲科、管理、工商；
