台湾有些人主张用第二次世界大战后的德国被分裂为两个国家后有重新统一的所谓“两德模式”来处理两岸关系。这是对历史和现实的误解。战后的德国分裂与两岸暂时分离是两个不同性质的问题。
主要有三点不同：第一，两者形成的原因，性质不同：1945年德国战败后被美，英，法，苏四国依据“鉴于德国失败和接管最高政府权力的声明”及其后的波茨坦协议，分区占领德国。冷战开始后，德国的统一问题成为美国和苏联在欧洲对抗的一个焦点，在美英法占领区和苏联占领区分别成立了联邦德国和民主德国，德国就被分裂为两个国家。显然，德国问题完全是由于外部因素造成的。而台湾问题则是中国内战遗留的问题，是内政问题；第二，两者在国际法上的地位不同。德国的分裂，为二战其间和战后一系列国际条约所规定。而台湾问题，则有“开罗宣言”，“波茨坦公告”等国际条约关于日本必须将窃取于中国的台湾归还中国的规定。第三，二者存在的实际状况不同。在美苏对抗的背景下，两个德国分别驻扎有外国的军队，被迫相互承认和在国际社会共存。而中国政府始终坚持一个中国的原则，李登辉上台之前的台湾当局和他上台初期也承认一个中国的原则，反对“两个中国”；一个中国的原则也被国际社会所普遍接受。
因而，德国问题与台湾问题不能相提并论，更不能照搬“两德模式”来解决台湾问题。